Bilim’ın Kök Hücre ve Rejeneratif Biyoloji (HSCRB) Zon laboratuvarından araştırmacılar, çeşitli kanserlerdeki hastalar için geniş etkileri olabilecek bir bulgu olan melanom gelişimini etkileyen yeni bir mekanizma keşfettiler.
Science dergisinde bu hafta açıklanan keşif, CDK13 olarak bilinen bir proteini içeriyor. Eski bir doktora sonrası araştırmacı ve makalenin ilk yazarı olan Megan Insco, “Bu makaleden önce kimse CDK13’ün kanserdeki rolünü bilmiyordu” dedi.
Insco ve ekibi, CDK13 proteininin melanomda bir tümör baskılayıcı görevi gördüğünü ve bunun mutasyonunun veya kaybının tümör gelişimine yol açabileceğini buldu. Melanom hasta verileri ve Zon zebra balığı modeliyle çalışan ekip, proteinin kaybına veya mutasyonuna neyin neden olduğunu ve altta yatan gen ifadesi de dahil olmak üzere bunun kansere nasıl yol açabileceğini öğrendi.
Hücreler rutin olarak gen ifade hataları yaparlar. Insco, hücrelerin daha sonra kansere yol açan anormal proteinler yapmaya devam eden kısaltılmış RNA’lar ürettiğini buldu. Neyse ki, hücreler aynı zamanda bu transkripsiyonel hataların icabına bakmak için aktif bir temizleme mekanizmasına sahiptir. “Fakat hücreler çöpü çıkaramazlarsa, bu RNA’lar birikir ve kansere neden olabilir” dedi. Bu yazıda ekip, mutant CDK13’ün anormal RNA’ların temizlenmemesinin nedeni olduğunu keşfetti.
Normalde, CDK13, RNA gözetimi gerçekleştiren hücrelerde dolaşır. Anormal bir RNA ile karşılaşırsa, hücrenin çekirdeğindeki kısa RNA’ları bozan birlikte çalışan (kompleks olarak bilinen) bir protein koleksiyonunu işe alır – özünde hataları ortadan kaldırır ve hücreyi bu kanser öncesi materyalden arındırır.
Bir proteinin kaybına veya mutasyonuna neyin neden olduğunu ve bunun kansere nasıl yol açabileceğini öğrenmek için Zon zebra balığı modelini kullanan Profesör Leonard Zon ve Megan Insco.
Ancak mutasyona uğrarsa CDK13, RNA gözetim görevlerini yerine getiremez ve esasen çöpü dışarı çıkarmayı durdurur. Insco, “Bu çöp RNA’ların kansere neden olduğunu biliyoruz çünkü onları zebra balığına geri koyduğumuzda, tüm bu süreci yeniden yansıttı” dedi.
CDK13 mutasyonları birçok insan kanserinde bulunur ve zebra balığı, fare ve insan hücrelerinde aynı işlevi görür. Ekip, zebra balığı çalışmalarında hasta melanom dokusunda mutasyona uğramış CDK13 ve hızlandırılmış melanom büyümesi gözlemledi.
Araştırmacılar ayrıca, nükleer RNA bozunmasının ilk adımı olan PAXT kompleksini içeren CDK13 mutasyonları için başka bir ima da ortaya çıkardılar.
Insco, “Bir etiketleme mekanizması olarak hizmet ediyor” dedi. Ancak CDK13 mutasyona uğrarsa, PAXT kompleksi aktive olmaz, “Elektrikli süpürgeyi açıp açmamak için bir anahtar gibi” diye ekledi.
Bu yeni makale, hasarlı RNA’ların aktif olarak düzenlendiğini ortaya koyarak, birçok hasta için kanser gelişim mekanizmasına yönelik imaların habercisidir. Yalnızca melanomda, hastaların yüzde 20’sinden fazlasında CDK13’ü içeren bu bozuk nükleer RNA gözetim mekanizması vardır.
Bilim Kök Hücre Enstitüsü profesörü ve yönetim kurulu başkanı Leonard Zon, “CDK13’ün insan kanserlerinde mutasyona uğradığı bulgusu, bu mekanizmanın kanserde daha geniş bir rol oynadığını gösteriyor” dedi.
CDK13 ile birlikte, PAXT kompleksinin en az iki diğer üyesi, sadece melanomda değil, birkaç kanser türünde tekrar tekrar mutasyona uğrar. Insco, “Bunun sadece bir CDK13 olayı olmadığına inanıyoruz, aynı zamanda elektrikli süpürgeyi kırmaya dahil olacak çok sayıda başka karmaşık üye var” dedi.
Bu çalışmaya dayanarak Insco, nükleer RNA sürveyansını daha iyi anlamak ve mevcut tedavilere yanıt vermeyen melanom hastalarına yeni terapötik yaklaşımlar sağlamak için yakın zamanda Dana-Farber Kanser Enstitüsünde kendi laboratuvarını kurdu. Zon laboratuvarı, tümörün başlamasıyla ilgili olarak RNA biyolojisini incelemeye devam edecek.
Science dergisinde bu hafta açıklanan keşif, CDK13 olarak bilinen bir proteini içeriyor. Eski bir doktora sonrası araştırmacı ve makalenin ilk yazarı olan Megan Insco, “Bu makaleden önce kimse CDK13’ün kanserdeki rolünü bilmiyordu” dedi.
Insco ve ekibi, CDK13 proteininin melanomda bir tümör baskılayıcı görevi gördüğünü ve bunun mutasyonunun veya kaybının tümör gelişimine yol açabileceğini buldu. Melanom hasta verileri ve Zon zebra balığı modeliyle çalışan ekip, proteinin kaybına veya mutasyonuna neyin neden olduğunu ve altta yatan gen ifadesi de dahil olmak üzere bunun kansere nasıl yol açabileceğini öğrendi.
Hücreler rutin olarak gen ifade hataları yaparlar. Insco, hücrelerin daha sonra kansere yol açan anormal proteinler yapmaya devam eden kısaltılmış RNA’lar ürettiğini buldu. Neyse ki, hücreler aynı zamanda bu transkripsiyonel hataların icabına bakmak için aktif bir temizleme mekanizmasına sahiptir. “Fakat hücreler çöpü çıkaramazlarsa, bu RNA’lar birikir ve kansere neden olabilir” dedi. Bu yazıda ekip, mutant CDK13’ün anormal RNA’ların temizlenmemesinin nedeni olduğunu keşfetti.
Normalde, CDK13, RNA gözetimi gerçekleştiren hücrelerde dolaşır. Anormal bir RNA ile karşılaşırsa, hücrenin çekirdeğindeki kısa RNA’ları bozan birlikte çalışan (kompleks olarak bilinen) bir protein koleksiyonunu işe alır – özünde hataları ortadan kaldırır ve hücreyi bu kanser öncesi materyalden arındırır.
Bir proteinin kaybına veya mutasyonuna neyin neden olduğunu ve bunun kansere nasıl yol açabileceğini öğrenmek için Zon zebra balığı modelini kullanan Profesör Leonard Zon ve Megan Insco.
Ancak mutasyona uğrarsa CDK13, RNA gözetim görevlerini yerine getiremez ve esasen çöpü dışarı çıkarmayı durdurur. Insco, “Bu çöp RNA’ların kansere neden olduğunu biliyoruz çünkü onları zebra balığına geri koyduğumuzda, tüm bu süreci yeniden yansıttı” dedi.
CDK13 mutasyonları birçok insan kanserinde bulunur ve zebra balığı, fare ve insan hücrelerinde aynı işlevi görür. Ekip, zebra balığı çalışmalarında hasta melanom dokusunda mutasyona uğramış CDK13 ve hızlandırılmış melanom büyümesi gözlemledi.
Araştırmacılar ayrıca, nükleer RNA bozunmasının ilk adımı olan PAXT kompleksini içeren CDK13 mutasyonları için başka bir ima da ortaya çıkardılar.
Insco, “Bir etiketleme mekanizması olarak hizmet ediyor” dedi. Ancak CDK13 mutasyona uğrarsa, PAXT kompleksi aktive olmaz, “Elektrikli süpürgeyi açıp açmamak için bir anahtar gibi” diye ekledi.
Bu yeni makale, hasarlı RNA’ların aktif olarak düzenlendiğini ortaya koyarak, birçok hasta için kanser gelişim mekanizmasına yönelik imaların habercisidir. Yalnızca melanomda, hastaların yüzde 20’sinden fazlasında CDK13’ü içeren bu bozuk nükleer RNA gözetim mekanizması vardır.
Bilim Kök Hücre Enstitüsü profesörü ve yönetim kurulu başkanı Leonard Zon, “CDK13’ün insan kanserlerinde mutasyona uğradığı bulgusu, bu mekanizmanın kanserde daha geniş bir rol oynadığını gösteriyor” dedi.
CDK13 ile birlikte, PAXT kompleksinin en az iki diğer üyesi, sadece melanomda değil, birkaç kanser türünde tekrar tekrar mutasyona uğrar. Insco, “Bunun sadece bir CDK13 olayı olmadığına inanıyoruz, aynı zamanda elektrikli süpürgeyi kırmaya dahil olacak çok sayıda başka karmaşık üye var” dedi.
Bu çalışmaya dayanarak Insco, nükleer RNA sürveyansını daha iyi anlamak ve mevcut tedavilere yanıt vermeyen melanom hastalarına yeni terapötik yaklaşımlar sağlamak için yakın zamanda Dana-Farber Kanser Enstitüsünde kendi laboratuvarını kurdu. Zon laboratuvarı, tümörün başlamasıyla ilgili olarak RNA biyolojisini incelemeye devam edecek.